Історія Навчально-наукового інституту інформаційних технологій розпочинається з 1 вересня 1990 року. Тоді денний факультет Київського філіалу Одеського електротехнічного інституту зв'язку (КФ ОЕІЗ), деканом якого був кандидат технічних наук, доцент Уваров Ростислав Васильович було реорганізовано в факультет автоматичного електрозв'язку. Деканом факультету з дати його створення був кандидат технічних наук, доцент Марков Сергій Юхимович. З 1998 року по липень 2004 року факультет очолював кандидат технічних наук, доцент Шестак Ігор Васильович. З серпня 2004 року по серпень 2006 року деканом факультету був доктор технічних наук, професор Смирнов Володимир Сергійович. З 1 вересня 2006 року по серпень 2014 року факультет Інформаційних технологій, який увійшов до складу Навчально-наукового інституту телекомунікацій та інформатизації Університету, очолював кандидат технічних наук, доцент Твердохліб Микола Григорович. 1 вересня 2014 року деканом факультету призначено кандидата технічних наук, доцента Бондарчука Андрія Петровича. У звязку зі збільшенням кількості студентів, більш ніж в два рази, з 1 травня 2019 року факультет ІТ було реорганізовано в окремий інститут - Навчально-науковий інститут інформаційних технологій